Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRACR2AQ9BSW2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms