Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYD88Q99836 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYD88Q99836 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms