Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LGMNQ99538 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LGMNQ99538 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms