Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF2Q99496 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF2Q99496 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms