Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CRBNQ96SW2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRBNQ96SW2 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms