Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS6KC1Q96S38 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS6KC1Q96S38 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms