Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LMTK3Q96Q04 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LMTK3Q96Q04 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LMTK3Q96Q04 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms