Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC85AQ96PX6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC85AQ96PX6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms