Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSPG4P5Q96PW8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSPG4P5Q96PW8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms