Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM47Q96LD4 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM47Q96LD4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms