Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDK5RAP3Q96JB5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDK5RAP3Q96JB5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms