Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
COG3Q96JB2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COG3Q96JB2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms