Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LRIG1Q96JA1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms