Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC10A4Q96EP9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC10A4Q96EP9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms