Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM44Q96DX7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms