Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPRY1Q96DX4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPRY1Q96DX4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPRY1Q96DX4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPRY1Q96DX4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPRY1Q96DX4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPRY1Q96DX4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPRY1Q96DX4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPRY1Q96DX4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RSPRY1Q96DX4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RSPRY1Q96DX4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms