Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HDAC11Q96DB2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HDAC11Q96DB2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms