Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C6Q969F1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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GTF3C6Q969F1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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GTF3C6Q969F1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
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GTF3C6Q969F1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C6Q969F1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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