Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-CQ95604 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HLA-CQ95604 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms