Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMO7Q8WWI1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms