Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATL2Q8NHH9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms