Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM71DQ8N9W8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM71DQ8N9W8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms