Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROM2Q8N271 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROM2Q8N271 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROM2Q8N271 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PROM2Q8N271 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PROM2Q8N271 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms