Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC47Q8N1G4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC47Q8N1G4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms