Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KRT28Q7Z3Y7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KRT28Q7Z3Y7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms