Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NUP54Q7Z3B4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP54Q7Z3B4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms