Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BHLHA9Q7RTU4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHLHA9Q7RTU4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms