Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HS2ST1Q7LGA3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms