Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SRCAPQ6ZRS2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SRCAPQ6ZRS2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms