Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMOD2Q6P5Q4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMOD2Q6P5Q4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms