Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS38

ALKBH2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH2Q6NS38 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ALKBH2Q6NS38 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms