Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB3L3Q68CJ9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms