Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RNF20Q5VTR2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RNF20Q5VTR2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms