Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
STRIP1Q5VSL9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STRIP1Q5VSL9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms