Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SOGA3Q5TF21 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOGA3Q5TF21 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms