Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
NHSL1Q5SYE7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NHSL1Q5SYE7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms