Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FRMPD1Q5SYB0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
FRMPD1Q5SYB0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms