Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PHYHD1Q5SRE7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms