Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM74A1Q5RGS3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms