Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DCAF6Q58WW2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DCAF6Q58WW2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms