Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC92Q53HC0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CCDC92Q53HC0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms