Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CEP55Q53EZ4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms