Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM259Q4ZIN3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM259Q4ZIN3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms