Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MSMPQ1L6U9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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