Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RTN1Q16799 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RTN1Q16799 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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