Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NDUFA9Q16795 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NDUFA9Q16795 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms