Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDKN3Q16667 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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