Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NRF1Q16656 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms