Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PCSK7Q16549 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PCSK7Q16549 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms