Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CDSNQ15517 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDSNQ15517 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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